Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIPK4Q8NE63 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HIPK4Q8NE63 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms