Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHLHE23Q8NDY6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms