Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM35BQ8NCS4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms