Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF169Q8NCN4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF169Q8NCN4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF169Q8NCN4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF169Q8NCN4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF169Q8NCN4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF169Q8NCN4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF169Q8NCN4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF169Q8NCN4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF169Q8NCN4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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RNF169Q8NCN4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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RNF169Q8NCN4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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RNF169Q8NCN4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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RNF169Q8NCN4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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RNF169Q8NCN4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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RNF169Q8NCN4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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RNF169Q8NCN4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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RNF169Q8NCN4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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RNF169Q8NCN4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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RNF169Q8NCN4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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RNF169Q8NCN4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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RNF169Q8NCN4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF169Q8NCN4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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