Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AVL9Q8NBF6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms