Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSGALNACT2Q8N6G5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSGALNACT2Q8N6G5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms