Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC43Q8N309 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC43Q8N309 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms