Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP3Q8IZU3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP3Q8IZU3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms