Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP6Q7Z6E9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP6Q7Z6E9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms