Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP54Q7Z3B4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP54Q7Z3B4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms