Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP31Q70CQ4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
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