Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms