Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VSTM1Q6UX27 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM1Q6UX27 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms