Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC174Q6PII3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms