Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETMD1Q6P1Q0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms