Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LCN10Q6JVE6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
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LCN10Q6JVE6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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LCN10Q6JVE6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LCN10Q6JVE6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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