Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCARA3Q6AZY7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCARA3Q6AZY7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms