Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIRMAQ69YN4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VIRMAQ69YN4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VIRMAQ69YN4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VIRMAQ69YN4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VIRMAQ69YN4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VIRMAQ69YN4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VIRMAQ69YN4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
VIRMAQ69YN4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIRMAQ69YN4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms