Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
INTS3Q68E01 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
INTS3Q68E01 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms