Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKR9

FAM104B, Protein FAM104B, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM104BQ5XKR9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM104BQ5XKR9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms