Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCERG1LQ5VWI1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms