Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GARNL3Q5VVW2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GARNL3Q5VVW2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GARNL3Q5VVW2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GARNL3Q5VVW2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GARNL3Q5VVW2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GARNL3Q5VVW2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GARNL3Q5VVW2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GARNL3Q5VVW2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GARNL3Q5VVW2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GARNL3Q5VVW2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GARNL3Q5VVW2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms