Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1orf53Q5VUE5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms