Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q5VSD8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q5VSD8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q5VSD8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q5VSD8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q5VSD8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q5VSD8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q5VSD8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q5VSD8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms