Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOGA3Q5TF21 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOGA3Q5TF21 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms