Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC3LQ5T215 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms