Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC122Q5T0U0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms