Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CELF3Q5SZQ8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF3Q5SZQ8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms