Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO47Q5MNV8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms