Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

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Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNT1Q5JUK3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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