Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XKR4Q5GH76 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XKR4Q5GH76 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms