Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF542PQ5EBM4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms