Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CMPK2Q5EBM0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMPK2Q5EBM0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms