Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms