Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF6Q58WW2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms