Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COBLL1Q53SF7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms