Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC38Q502W7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms