Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP221Q4G0U5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP221Q4G0U5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms