Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CERKLQ49MI3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERKLQ49MI3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms