Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC153Q494R4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms