Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPEL1Q2QD12 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms