Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GEN1Q17RS7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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