Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CA9Q16790 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CA9Q16790 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CA9Q16790 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CA9Q16790 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CA9Q16790 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CA9Q16790 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CA9Q16790 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CA9Q16790 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CA9Q16790 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CA9Q16790 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CA9Q16790 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CA9Q16790 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CA9Q16790 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CA9Q16790 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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CA9Q16790 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA9Q16790 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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CA9Q16790 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA9Q16790 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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CA9Q16790 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA9Q16790 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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CA9Q16790 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA9Q16790 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA9Q16790 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CA9Q16790 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA9Q16790 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA9Q16790 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA9Q16790 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA9Q16790 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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CA9Q16790 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA9Q16790 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA9Q16790 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA9Q16790 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CA9Q16790 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CA9Q16790 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA9Q16790 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA9Q16790 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA9Q16790 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CA9Q16790 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
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