Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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