Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
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FOXD1Q16676 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
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FOXD1Q16676 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
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FOXD1Q16676 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
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FOXD1Q16676 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
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FOXD1Q16676 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD1Q16676 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
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