Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ECM1Q16610 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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