Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CRY1Q16526 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRY1Q16526 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRY1Q16526 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRY1Q16526 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRY1Q16526 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRY1Q16526 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRY1Q16526 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRY1Q16526 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRY1Q16526 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRY1Q16526 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRY1Q16526 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRY1Q16526 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRY1Q16526 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRY1Q16526 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms