Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E2F4Q16254 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E2F4Q16254 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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