Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIBQ15653 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFKBIBQ15653 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
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