Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIP11Q15643 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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